Создан в 1951 г. как Институт биологии ЯФ АН СССР, предназначенный для изучения проблем почвоведения, биохимии и физиологии растений, ботаники, зоологии и животноводства. В 1989 г. переименован в Якутский институт биологии СО АН СССР, в 1997 г. в ИБПК СО РАН. Основные направления научной деятельности: экология организмов и сообществ (структурно-динамическая организация, функционирование и устойчивость экосистем криолитозоны); биологическое разнообразие (оптимизация и охрана биологических ресурсов криолитозоны). В структуру института входят 7 научных подразделений: биогеохимических циклов мерзлотных экосистем; ботанический сад; генезиса и экологии почвенно-растительного покрова; зоологических исследований; флористики, геоботаники и мерзлотного лесоведения; экологической и медицинской биохимии, биотехнологии и радиобиологии; экосистемных исследований холодных регионов. Директора: В. П. Дадыкин (1952-1954), Я. Л. Глембоцкий (1954-1957), В. Г. Зольников (1957-1960), В. А. Тавровский (1960-1968), И. П. Щербаков (1968-1986), Н. Г. Соломонов (1986-1997), Б. И. Иванов (1997-2006), П. А. Ремигайло (2007-2017), И. М. Охлопков (с 2017).