Изоляты микобактерий туберкулеза, полученные от больных с впервые выявленным туберкулезом из Иркутской области и Республики Саха (Якутия) за ноябрь 2008 - май 2010 гг., протестированы на лекарственную устойчивость и генотипированы с использованием метода MIRU-12. С помощью филогенетической реконструкции определены основные эпидемические генотипы туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ). На филогенетических моделях продемонстрированы четкие региональные различия проявления первичного туберкулеза с МЛУ, требующие территориально обоснованных стратегий диагностики и лечения
Multidrug-resistant tuberculosis without prior treatment (primary MDR-TB) is a major problem in the Russian Federation, and also in Eastern Siberia and Far East. Mycobacterium tuberculosis isolates from patients with primary Tb at two referral sites in Irkutsk oblast and the Sakha Republic (Yakutia) were tested for conventional susceptibility and genotyped using MIRU-12. Outcomes from primary MDR-TB were compared between sites. Phylogenetic reconstruction was used to determined basic epidemic genotypes with MDR. Primary MDR-TB was common in both regions and phylogenetic patterns; drug-resistance and outcomes carried regionally distinct differences, emphasizing the need for locally informed diagnosis and treatment strategies

Цель: реконструкция эпидемического распространения штаммов генотипа Beijing Mycobacterium tuberculosis на территории с ограниченными миграционными событиями на основе сравнительного изучения 153 изолятов, полученных от больных разных поколений из Республики Саха (Якутия). Материалы и методы. Путем MIRU-VNTR-генотипирования, субтипирования по участкам генома RD105/RD207, классификации паттернов по клональным комплексам Merker M. et al. (2015) и филогенетического моделирования была описана и проанализирована структура популяции Mycobacterium tuberculosis. Результаты. Показано, что высокотрансмиссивные субтипы генотипа Beijing, несущие высокий потенциал формирования антибиотикорезистентности, значимо чаще (χ2 = 8,3, p < 0,01) встречаются у молодых (после 1990 года рождения), чем в старшем поколении (до 1959 года рождения). Определен сдвиг в структуре популяции возбудителя, который произошел во время предыдущих пяти десятилетий. Заключение. Полученные данные подтверждают предположение более позднего заноса эпидемических субтипов генотипа Beijing (около пятидесяти лет назад) на территорию Республики Саха (Якутия) по сравнению с другими регионами России
Goal: reconstruction of epidemic transmission of Beijing genotype of Mycobacterium tuberculosis on the territory with limited migration based on the comparative study of 153 isolates isolated from patients of different generations in the Sakha Republic (Yakutia). Materials and methods. The structure of Mycobacterium tuberculosis population was described and analyzed through

В Республике Саха (Якутия) в последние годы ведутся работы по изучению молекулярной эпидемиологии туберкулеза. В большинстве случаев в регионе выявляются Mycobacterium tuberculosis (МБТ) генотипа Beijing, который признан эпидемически значимым для данного региона Крайнего Севера. Вместе с тем выявляются МБТ генотипа S с большей частотой, чем в других регионах России. Особый интерес представляет подтип S256, выявляемый крайне редко в России, но встречающийся достаточно часто у аборигенов Северной Америки

The objective: to study treatment efficacy in new pulmonary tuberculosis patients depending on the genotypes of M. tuberculosis in the Republic of Sakha (Yakutia). Subjects and methods. The authors studied the clinical course and outcomes of 312 bacteriologically confirmed new pulmonary tuberculosis cases among patients admitted to hospital in 2010-2014. Molecular genetic tests included deletion analysis of RD105 and RD207 regions of DNA of the pathogen followed by MIRU-VNTR genotyping at 24 loci. Results. In the Republic of Sakha (Yakutia), the Beijing and S genotypes are of epidemic importance, these genotypes prevail among drug resistance mycobacteria. Tuberculosis caused by the Beijing genotype had multiple (MDR) and extensive drug resistance (XDR) in 30.6% of cases, its subtype CC2/W148 - in 85.3%. The S genotype was accompanied by MDR/XDR in 69.7% of cases, subtype S256 - in 78.9%. The treatment of patients was highly efficient according to the criteria of sputum conversion (92%) and cavities healing (89.4%). The lowest rates were observed in case of tuberculosis caused by the Beijing and S genotypes due to their subtypes CC2/W148 and S256. Clinical cure of new pulmonary tuberculosis caused by the Beijing genotype was achieved in 73.4% of cases, by subtype CC2/W148 - in 41.2% with a significantly higher proportion of treatment failures and lethal outcomes of tuberculosis than in other subtypes of this genotype. With the S genotype, the clinical cure was achieved in 72.7% of patients, with no significant difference in the incidence of unfavorable outcomes in patients with subtype S256